"Эпизод с убийством Афанасьева был лишь отправной точкой в широкомасштабном расследовании инициированном КГБ и поддержанном Генеральной прокуратурой СССР, в результате которого были выявлены массовые нарушения работниками милиции Москвы служебных полномочий, в том числе сопряженные с причинением увечий, грабежами и убийствами. Более 300 сотрудников линейных отделений милиции были уволены из органов. Личный состав линейного отделения № 5 (в ведении которого находилась ст.м. «Ждановская») был уволен полностью.
В результате расследования, параллельно было раскрыто несколько десятков других преступлений, среди которых, следует отметить, бегство на Запад вместе с семьей сотрудника аппарата КГБ.
В конечном счете, обстоятельства дела привели к смещению с поста министра МВД Щёлокова, началом его опалы, доминированию роли КГБ среди силовых структур СССР.
Фигуранты дела об убийстве Афанасьева были приговорены судом к длительным срокам заключения, четверо (Барышев, Лобанов, Рассохин и Попов) — к расстрелу. Суд проходил в закрытом режиме, так как на высшем уровне было принято решение не омрачать образ милиционера в глазах советского человека.